Книжка «Добраніч, Пунпуне. Том 2» розповідає про абсолютно посереднього учня середньої школи Пунпуна Онодера, який страждає від нероздільного кохання до Айко Танаки.
Він укладає парі із зіркою з секції бадмінтону, старшокласником Яґучі. Хлопчині доводиться досліджувати нелегкі аспекти життя та намагатися зрозуміти своє місце в цьому світі.
У цей час його дядько Юічі відкриває таємницю свого минулого дівчині з кав’ярні — Мідорі Окума.
Чи існує шанс на спасіння? Чи вдасться зробити правильний вибір?